台灣島隆起之後，島上岩石開始被侵蝕，大量的砂泥與礫石堆積到東岸的深海中，形成許多的深海沖積扇。這些來自造山帶（古台灣島）的沉積物就堆積在大陸斜坡（continental slope）至大陸隆起（continental rise）上。300萬年以來，共形成三個深海沖積扇，迄今，這古老的沖積扇都已隆起出露在海岸山脈中－水璉沖積扇、磯崎沖積扇與奇美沖積扇（圖1-14）。

深海沖積扇形成原因有兩種，最常見且會形成較大型沖積扇的是，陸上具有一河流提供大量沉積物搬運到大陸斜坡下，地形特徵會在大陸斜坡上產生海底峽谷（河道）。另一原因是處於不穩定的大陸斜坡下，斜坡經常產生崩移作用，而在斜坡下形成沖積扇，此種成因會在沖積扇上游產生一個圓弧形的崩塌地形。另外，由河流所堆積的深海沖積扇，可能會有較粗粒的沉積物，例如海岸山脈的深海沖積扇，沉積物直接來自鄰近的山脈。

深海沖積扇的沉積物特性，與水流的搬運機制有關，水流流經大陸斜坡時受到重力的牽引作用，而使流速加快，當愈遠離大陸斜坡時，水流的搬運能力愈弱。因此堆積在大陸斜坡上河道的沉積物較粗，呈現厚層礫岩（圖1-15）與砂岩（圖1-16），河道兩側河堤外的氾濫平原堆積厚層的泥岩。斜坡環境屬於上部沖積扇（upper deep-sea fan）。當沉積繼續往下搬運，堆積在大陸隆起（continental rise）時，沖積扇河道以厚層砂岩為主（圖1-17），兩側氾濫平原以砂岩為主的砂頁岩互層（圖1-18），屬於中部沖積扇（middle deep-sea fan）。再往下游堆積時，沉積物以頁岩為主的砂頁岩互層，偶而夾有數公尺至十數公尺的厚層砂岩，或以頁岩為主，屬於下部沖積扇（lower deep-sea fan）。